Les progrès marquants de la recherche en agronomie et en écologie se sont souvent faits ces dernières années dans un cadre explicitement évolutionniste. La formation des jeunes chercheurs dans ces domaines exige une formation théorique conséquente des logiques de sélection, d'évolution, et d'adaptation des organismes qui vient compléter un apprentissage de mécanismes biologiques élémentaires. Le Master 2 BOP a pour ambition de conférer aux futurs diplômés une double compétence à la fois dans le domaine de l'écologie évolutive et dans l'utilisation raisonnée de variants naturels ou artificiels à des fins de recherche fondamentale ou appliquée. Ceci passe par une formation pertinente et objective en ce qui concerne l'estimation des différents risques inhérents à ce type de démarche. A cet effet, cette nouvelle formation prévoit de concilier expertise technique en biologie moléculaire et microbiologie et savoirs théoriques de pointe dans les domaines de la biologie des populations, de l'écologie et de l'évolution. Les trois domaines de spécialisation sont : écologie et systèmes de culture, écologie microbienne, écologie comportementale.